Основні положення проекту Концепції включають в себе цілі та пріоритети за всіма напрямками роботи митної служби України - від реформування структури митних органів до здійснення кардинальних змін процесів митного контролю та митного оформлення.
В процесі реформування структури митної системи створюється вертикальна організаційно-управлінська система “Державна митна служба - регіональні митниці - митниці”, організована за територіальним принципом з урахуванням адміністративно-територіального устрою держави.
На першому етапі реформування структури митних органів наказом Держмитслужби від 15 вересня 2006 року №785 створені та з 1 жовтня поточного року будуть функціонувати п’ять регіональних митниць: Західна - з розташуванням у Львові, Центральна - в Києві, Східна - в Донецьку, Південна - в Одеса та Кримська - в Сімферополі.
Західна регіональна митниця створюється на базі ліквідованої Львівської митниці. Зоною діяльності Західної регіональної митниці визначено:
- щодо безпосереднього здійснення митного контролю та оформлення - зону діяльності, яка була визначена для Львівської митниці;
- щодо контрольно-розпорядчих функцій з питань митного контролю та митного оформлення - Волинську, Закарпатську, Івано-Франківську, Рівненську, Тернопільську, Хмельницьку, Чернівецьку області, пункти пропуску через державний кордон між Україною та Республікою Польща з підпорядкуванням Західній регіональній митниці Вадул-Сіретської, Виноградівської, Волинської, Івано-Франківської, Кельменецької, Мостиської, Рава-Руської, Рівненської, Тернопільської, Ужгородської, Чопської, Хмельницької, Яворівської та Ягодинської митниць.